Povzetek
12.000 let po dogodkih v Sousei no Aquarion človeštvu grozi nov sovražnik iz druge dimenzije, imenovan »ugrabitelji«, ki prav tako kot angeli v senci napadajo človeška mesta, da bi ugrabili njegove prebivalce. Za zaščito človeštva pred to invazijo je organizacija Neo-DEAVA ustanovila dve skupini, eno sestavljeno samo iz moških in drugo iz samo žensk, vsaka pa pilotira s svojimi velikanskimi stroji, imenovanimi "Aquaria". Da bi zaščitil svojega novega prijatelja Mikona, se je najstnica Amata Sora odločila, da bo uporabila moči, ki jih je skrival celo življenje, in tako, da je Vektorje z moškimi in ženskimi piloti združil v enega samega robota, se je legendarni velikan Aquarion znova rodil.